Menigheten må ha et fungerende system for regnskapsføring. Dette består minimum i registrering av inn- og utgående bilag, og skal revideres årlig av valgt intern revisor. Dette skal være en annen enn menighetens leder eller regnskapsfører.
Regnskapet skal settes opp på oversiktlig vis med balanseoppsett (oversikt over eiendeler, egenkapital og gjeld) og resultatregnskap (oversikt over menighetens inntekter og kostnader), og legges fram for menighetens årsmøte for godkjenning etter at det er revidert av internt valgt revisor.
Regnskapet kan føres på forskjellige måter. Det mest vanlige er å føre en oversikt over innsamlede midler og andre inntekter, samt lønnskostnader og driftskostnader. Regnskapet kan føres i Excel, men dette er ikke hensiktsmessig dersom det er et stort regnskap med mange bilag. Vi anbefaler derfor bruk av et regnskapsprogram. Et enkelt program som er tilpasset menighetsdrift finnes hos Matrix.